Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CIPCQ9C0C6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CIPCQ9C0C6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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