Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NLRP1Q9C000 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NLRP1Q9C000 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms