Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRXQ9BXM0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms