Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms