Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf16Q9BUW7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms