Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms