Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGIP1Q9BQI5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms