Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB3IPQ96QF0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms