Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPR78Q96P69 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPR78Q96P69 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms