Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PRAC1Q96KF2 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms