Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP47Q96K76 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP47Q96K76 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms