Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms