Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BICD1Q96G01 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms