Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms