Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYTL4Q96C24 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms