Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAVIN3Q969G5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms