Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMARCE1Q969G3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms