Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRAT1Q92837 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms