Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C17orf47Q8NEP4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms