Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PLD3Q8IV08 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms