Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms