Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms