Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms