Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms