Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SDE2Q6IQ49 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms