Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PRAMEF20Q5VT98 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PRAMEF20Q5VT98 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PRAMEF20Q5VT98 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PRAMEF20Q5VT98 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF20Q5VT98 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms