Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HES3Q5TGS1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms