Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A3Q5K4L6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC27A3Q5K4L6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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