Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms