Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FHOD3Q2V2M9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FHOD3Q2V2M9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms