Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ODF4Q2M2E3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms