Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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