Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM187BQ17R55 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM187BQ17R55 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms