Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UPP1Q16831 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms