Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPROQ16827 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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