Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC18A3Q16572 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC18A3Q16572 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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