Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NTRK3Q16288 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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