Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6AP1Q15904 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms