Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NEDD8Q15843 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms