Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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