Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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