Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA3AQ14563 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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