Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCNC3Q14003 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms