Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ITGA9Q13797 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGA9Q13797 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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