Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
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SHROOM2Q13796 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
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SHROOM2Q13796 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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SHROOM2Q13796 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SHROOM2Q13796 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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SHROOM2Q13796 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
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SHROOM2Q13796 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
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SHROOM2Q13796 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
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SHROOM2Q13796 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHROOM2Q13796 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
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