Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRSF6Q13247 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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