Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CBX3Q13185 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX3Q13185 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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