Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IFT88Q13099 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IFT88Q13099 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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