Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSTF3Q12996 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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