Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms